La directiva del Club Deportivo Guadalajara informó a los medios que se llegó a un acuerdo con Rafael Lebrija para que deje de fungir como Presidente Deportivo de la institución para que pueda atender al cien por ciento sus proyectos personales.
Lebrija llegó a Chivas el 24 de septiembre de 2009 para tomar el cargo que dejó vacante Pedro Sáez, y a su llegada prometió trabajar para poder cumplir con los objetivos que tenía trazada la institución.
Durante su corta estancia con el equipo, Lebrija se encargó de darle las gracias al técnico Raúl Arias y le dio la responsabilidad a José Luis Real de tomar la dirección técnica del equipo.
Rafael Lebrija se suma así a Ivar Sisniega, Juan José Frangié, Néstor de la Torre y Pedro Sáez como uno más de los directivos que han desfilado por el Guadalajara bajo el mandato de Jorge Vergara.